水晶的保养称为清洗，即消磁和净化。无论你把水晶作为饰物、摆设或幻想使用水晶的神奇力量，水晶买回来均需要先清洗才能达到有效的作用。因为水晶从开采的那一刻直到你的手中，经历过不同人的接触，水晶的物理记忆性会将他们的思想、运程及身状况完全记录下来。所以我们要先把水晶中所有存在的信息记录完全清除，以便输入自己的信息，这样使用水晶时，你便不会受前人的影响。
阳光消磁清洗法
清洗方法：只要将晶石放于可被阳光直接照射的位置，例如窗台及露台等；照射时间约为30分钟至1小时。注意事项：(1)晶石在阳光照射下会产生聚焦作用，如在晶石附近摆放了纸张或其它可燃烧物品，会有引起火险的危险。(2)但如果晶石的色原素含有铜与铁，便不适用于此类清洗方法，由于此等物质在阳光底下受到长时间照射，会产生氧化作用，因而令到晶石退色。含有铜与铁的色原素包括有红色或紫色等水晶石。
月光星晨照射法
清洗方法：每逢农历十五月圆之夜，由于当夜是月亮的光芒特别强，正是晒石的好时机，晒石方法非常简单，只要将晶石放于露台或窗边，接受月光照射一晚的时间即可。此外，亦可在天朗气清，星光闪闪的晚上，将晶石放在露台上，让它吸收星光的精华，以达到净化晶石的效果。另外，除了月圆之夜外，亦可选择月圆的前后几天，同样适合此类晒石方法。注意事项：如接受照射的是紫色或红色的晶石，请紧记必须在翌日中午之前将晶石收回，否则日间的猛烈阳光会影响晶石的色素，令之退色。
海盐浸洗法
清洗方法：将晶石放进一杯以适量海盐洋( 或粗盐 )开匀的盐水中，浸三至四个小时，即可消解晶石周围的磁场。注意事项：(1) 如晶石是镶嵌在金属物中制成饰物，如戒子、吊咀等等，则请先将晶石拆离金属物才放进盐水浸泡，否则会影响到金属物表面的色泽与亮度。(2) 请留意，此类清洗方法或会令到晶石的内含物在清洗后有所改变。
此外，还有海盐埋藏法，雪堆埋藏法，清水净化法，香熏净化法，晶簇净化法，自然清洗化。
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